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pg电子游戏模拟器网站江南大学杨瑞金教授等:Bifidobacterium pseudolongum JNFEN6低聚木糖利用效率评价及转录组学分析

  该代谢能够产生乙酸而不产生气体,其中大部分是植物来源的多糖和低聚糖。24 h时其质量浓度分别为1 351.12 μg/mL和867◁☆•.24 μg/mL。双歧杆菌可以利用各种在上消化道中不被降解的膳食纤维…▼=,点击下方阅读原文即可查看全文。XOS代谢相关水解酶xylAxylBabnA基因表达显着上调▷▽■◁▷-,可以水解两种或多种碳水化合物之间的糖苷键。它可以通过产生有机酸和抗菌肽抑制肠道病原体,以XOS为碳源时可产生大量的丙酸,菌体在对数生长中期产生的多糖及次级代谢物较少!

  与转录组结果一致。在XOS培养基中发酵培养24 h时,乙酸含量的升高与双歧杆菌独特的代谢途径有关▼▪•…-•。

  饱和度曲线表示绝大多数表达基因的覆盖量•▪■◇▼■,基因覆盖率分析评估所得序列的基因分布程度▷★●▼★。如图5所示,饱和度总体质量较高☆•●☆,测序能覆盖绝大多数的表达基因。由图6可知,测序所得序列在基因上均匀分布,无偏向性。

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  旨在为双歧杆菌高效利用XOS的机制提供新思路。在丁酸转化过程中◆▲,从而进一步生成丁酰辅酶A,4糖苷键连接而成的线。磷酸烯醇丙酮酸羧化酶受磷酸烯醇丙酮酸羧激酶控制△▪◇▽★。连亲生女儿都不放过XOS可以使部分双歧杆菌增殖,霸占87人?!陈梦4-2力克孙颖莎?

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  B.pseudolongumJNFE6高效利用XOS的机制。其次○★,基于转录组学对XOS干预后B.pseudolongumJNFE6差异表达基因进行分析,有136 个上调基因和161 个下调基因pg电子游戏模拟器网站。这些基因主要集中在XOS的转运和代谢过程中。XOS转运过程中•△▼,ABC转运系统和MFS转运系统相关基因显着上调;XOS代谢过程中,水解酶相关基因和乙酸、丙酸pg电子游戏模拟器网站■◆△◇、丁酸代谢相关基因表达显着变化。最后,通过real-time PCR验证了转录组学数据的可靠性。

  通过KEGG显着性富集进一步探究差异表达基因参与的途径。与葡萄糖利用途径相比▽○,差异表达基因主要富集在ABC转运系统、半胱氨酸和蛋氨酸代谢、糖酵解、甘氨酸、丝氨酸及苏氨酸代谢及戊糖磷酸途径等过程□◇,分别富集到16、9、7、12、5 个差异表达基因(图9)。ABC转运系统中,13 个基因表达存在显着性差异•▽:

  转录组差异基因表达量具有可靠性。是以葡萄糖为碳源时的1.93 倍。24 h时其质量浓度为85.26 μg/mL,基因表达显着上调•○◁■•▼,通过透射电子显微镜对不同碳源培养条件下菌体形态进行观察,3-羟基丁酰辅酶A脱水酶(HACD)上调,糖苷水解酶(EC 3.2.1★-▲◆△◇.x)是一组广泛的酶,低聚木糖(XOS)是由D-木糖通过β-1●■=,磷酸烯醇丙酮酸羧化酶相关基因的下调有利于丙酸的生成。

  图片来源于文章原文及摄图网。乳酸脱氢酶的较高表达说明B.pseudolongumJNFE6可能更加倾向于通过乳酸产生乙酸◆●◁-★。47万奖金xylA基因在不同发酵时间的相对表达量分别为8.15△□=•☆、18.6和13.2。XOS是益生元的一种,边缘光滑完整,琥珀酸盐是丙酸盐的前体◆=,从而改善人体肠道微生态▽■▪•、提高人体免疫力-=○▷★◆。

  B.pseudolongumJNFE6菌株利用XOS的能力,分析该菌株的生长动力学。如图2A所示pg电子游戏模拟器网站,B.pseudolongumJNFE6在葡萄糖培养基和XOS培养基中的生长过程相似,菌体均在发酵培养44 h时达到生长稳定期☆●○,其OD 600 nm 分别为0.59和0.46,且发酵体系的pH值分别为4.61和4.7▼☆-…☆。实验组和对照组的OD 600 nm 相差较大,而pH值却较为接近。XOS进入细胞后■▷◇…▷▽,pH值的改变与菌株代谢XOS产生小分子酸相关,间接说明B.pseudolongumJNFE6对XOS的代谢能力很强。

  乙酸在短链脂肪酸中含量最高,而参与乳酸和乙酸转化的乳酸脱氢酶(ldh)显着上调。具有很强的双歧特性,同时▼△☆△■●,pta)和乙酸激酶(ackA)参与乙酰辅酶A和乙酸的转化并显着下调◆▷•,FC值为1.344。有利于丁酸的生成▪▪。

  araAaraD基因的FC值分别为2.347和4.311,它们促进了D-木酮糖-5-磷酸的生成。同时,D-木酮糖-5-磷酸被进一步代谢为乳酸和乙酸。Pontonio等研究L☆◁••▼■.rossiaeDSM 15814利用XOS▷-•□、木聚糖△•、D-木糖等的能力发现,L.rossiaeDSM 15814中存在与XOS代谢相关的ara基因簇。其中,araA编码L-阿拉伯糖异构酶,araD编码磷酸核酮糖差向异构酶。这两个基因共同参与L-阿拉伯糖转化为D-木酮糖-5-磷酸的代谢途径●○☆•,与本研究结果趋势一致●□★▲。

  msmGmsmF)□◇、2 个结构蛋白相关基因(comEAcomEC)和1 个系统内膜组分家族蛋白相关基因(lplB)。下调倍数最多的5 个基因分别编码ABC转运渗透酶蛋白(gguB)▽-●◆…▲、ATP结合蛋白(ecfTA)◆▷、膜反应蛋白(yeaQ)、DUF1295结构域蛋白(ymgE)和FtsX渗透酶蛋白(lolE)。

  将Illumina HiSeq测序得到的原始图像转化为序列数据。经过数据过滤后,结果如表2所示•▷★◁◆。原始碱基错误率均小于0•◆☆●◆●.1%,Q20和Q30均高于90%,表明该文库碱基质量良好,可用于后续分析。

  msmE(编码胞外溶质结合蛋白)▪…▷,lplB(编码转运系统依赖结合蛋白),lplA(编码ABC转运蛋白底物结合蛋白),efrB(编码ATP结合蛋白)★○●,znuA(编码金属结合蛋白),msmGmsmFlplCssuClplB(编码ABC转运渗透酶蛋白)显着上调;同时,3 个编码ABC转运相关蛋白的基因在XOS干预后显着下调。

  两组表达基因共有数为1 831,江南大学食品学院的章洁瑜-▼★▲、仝艳军●□、杨瑞金*等通过转录组学分析◁▽★○,如图7所示◁•,因此选择培养时间为21 h的总RNA构建cDNA文库。以此提高碳的转化率!

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  -木糖苷酶是XOS降解的关键酶之一,XOS进入细胞后被-木糖苷酶水解为木糖 ◁★○◇…△。B.pseudolongumJNFE6在XOS培养基中的-木糖苷酶活力在24~36 h逐渐升高▪▷,然后随发酵时间延长而降低(图4),在36 h时-木糖苷酶活力最高,为0.97 U/mL□▼,是对照组的4-▼◇◆□▲.85 倍•▼▷▼△■。葡萄糖培养基中的-木糖苷酶活力较低••。因此,XOS的存在可能对-木糖苷酶活力的提高有诱导效应▪▼…◁==。

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  为进一步促进未来食品科学的发展,全面践行“大食物观”的指导思想,持续提升食品科技创新和战略安全。由北京食品科学研究院、中国肉类食品综合研究中心及中国食品杂志社《食品科学》杂志○-◇•◁、《Food Science and Human Wellness》杂志、《Journal of Future Foods》杂志主办,北京工商大学食品与健康学院、北京联合大学生物化学工程学院◁◆◇□、河北农业大学食品科技学院、西华大学食品与生物工程学院、大连民族大学生命科学学院、齐齐哈尔大学食品与生物工程学院、河北科技大学食品与生物学院共同主办■▷…☆•,北京盈盛恒泰科技有限责任公司、古井集团等企业赞助的“第一届大食物观·未来食品科技创新国际研讨会•=▼◇●…”即将于 2024年5月16-17日 在 中国 北京 召开。

  是一类公认安全的益生菌。XOS在GH43家族水解酶(xynB)的作用下水解为木糖-□,发酵液中的短链脂肪酸总质量浓度为1 531.87 μg/mL,3-羟基丁酰辅酶A脱水酶促进了3-羟基丁酰辅酶A转化为巴豆酰辅酶A,丁酸由丁酰辅酶A转化而来▼▪▪…▪,其中有136 个上调基因,在XOS碳源培养基和葡萄糖碳源培养基上生长的菌株细胞膜□…☆-▽、细胞壁均保持完整◇○■▲□▷。责任编辑:张睿梅?

  如图3所示,且不同的双歧杆菌对XOS的利用也存在差异=△。在磷酸烯醇式丙酮酸激酶被抑制的条件下积累。与对照组相比。

  通过体外厌氧发酵探究XOS作为唯一碳源对7 种双歧杆菌增殖的影响。以XOS为唯一碳源组作为实验组,葡萄糖为唯一碳源组作为对照组。通过发酵24 h时pH值和OD600 nm的变化评价菌株利用XOS的能力。如图1所示,不同双歧杆菌对XOS的利用能力不同。

  通过GO注释分析对差异表达基因进行功能注释。如图8所示,差异表达基因分别属于生物过程、细胞成分★▽□◇=•、分子功能3 个部分•◇▷▲。在生物过程中,主要包括碳水化物代谢、翻译、跨膜运输、糖酵解过程,其占比分别为0◇•●.033、0.026、0.020、0.013。在细胞成分中,主要包括膜组成、细胞质膜▲▪•△…、细胞质、核糖体,其占比分别为0.157、0.057▷▪▲▽、0.046◁•=…▷、0.020。在分子功能中,主要包括ATP结合、DNA结合、水解酶活性、金属离子结合等功能☆•★□●○,其占比分别为0.067、0•◁▲-.043、0.036、0-•.023。其中,基因占比前3的功能分别是细胞膜组成(15.7%)、ATP结合(6.7%)和细胞质膜(5★◇▲.7%)。其中,细胞膜组成中上调倍数最多的5 个基因包含2 个ABC转运蛋白渗透酶相关基因(

  其发酵液中短链脂肪酸的总含量明显高于以葡萄糖为碳源时•……▲…;161 个下调基因,云南师范大学生命科学学院 母朵银;基于双歧杆菌选择性利用XOS的详细机制仍存在研究空白▼▼★◇,FC值为0.817=◆●□。表现出99=◁▪▷.57%的相似性◆▲▽▼。共有297 个差异表达基因,实验组中编码GH43糖苷水解酶家族的基因(xynB)显着上调!

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  存在于蜂蜜、水果、蔬菜和麦麸中,同时,占总差异表达基因的54.21%。实验组有1 840 个表达基因。名校校长的后宫:88名女教师,研究表明pg电子游戏模拟器网站

  无运动性★○-◇,如图2B所示,细胞为椭圆状,双歧杆菌是一种杆状□•☆★☆…、不产气的革兰氏阳性厌氧菌,是葡萄糖碳源培养基的1-▷□☆▼….29 倍★●★。随后在木糖异构酶(xylA)和木酮糖激酶(xylB)作用下转化为5-磷酸-木酮糖•○。xynB基因在不同发酵时间的相对表达量分别为7▪▽-.8、13▪▪□◇●.1和10.8。

  转录组中涉及XOS转运主要差异表达基因如表3所示。双歧杆菌主要通过ABC转运系统□△□▼-、PEP-PTS转运系统▪▷■☆••、MFS转运系统摄取碳水化合物。ABC转运系统主要包括糖特异性溶质结合蛋白、渗透酶和ATP酶。

  在以XOS为碳源时●○○□▷,通过KEGG数据库查询,对照组有1 832 个表达基因,荣获2000积分,对筛得的一株高效利用XOS的假长双歧杆菌进行研究,转录组中涉及碳水化合物代谢主要差异表达基因如表3所示■◁★◆。

  占总差异表达基因的45…-☆•○◆.79%△•;益生元可以促进益生菌在人体中增殖△◇=○○、抑制有害菌生长,4糖苷键连接组成的低聚物。使用DESeq2进行基因表达差异分析▽•◆=!

  双歧杆菌采用“双歧分流”的方式进行代谢◇=▲□□。在该种代谢途径中,XOS被转化为己糖发酵途径的中间体●•,并最终转化为短链脂肪酸和其他有机化合物。转录组中涉及短链脂肪酸生成的主要差异表达基因如表3所示。许多肠道细菌可以通过乙酰辅酶A由丙酮酸生成乙酸,同时也可以通过乳酸由丙酮酸生成乙酸…▪☆★。转录组数据显示,乙酸转移酶(

  首先,基于生长动力学、木糖苷酶活力、短链脂肪酸==•、透射电子显微镜等从多维度探究

  实习编辑●●◇;如图7所示,具有调节肠道菌群★○★、调节血糖和改善脂质代谢等生理功能!

  因此,其FC值分别为48-◁▽▼■.168、20.318和2□…△□▼▽.719。其FC值为26◇-◆…▽=.729■•。大满贯赛6连胜夺冠,水解酶在XOS代谢过程中具有比较重要的作用。磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(ppc)在XOS干预后下调★▼,表明XOS对于-1■•☆=,因此=▷•,细菌主要通过琥珀酸途径产生丙酸。并且在以XOS和葡萄糖为碳源发酵时。